問：我公司全年發放的合理工資總額為200萬元，為職工支付補充養老保險12萬元，補充醫療保險8萬元。我公司將為職工支付的補充養老保險和補充醫療保險全額在稅前作了扣除，這樣處理正確嗎?

答：企業所得稅法實施條例第三十五條規定，企業依照國務院有關主管部門或者省級人民政府規定的范圍和標準為職工繳納的基本養老保險費、基本醫療保險費、失業保險費、工傷保險費、生育保險費等基本社會保險費和住房公積金，準予扣除。企業為投資者或者職工支付的補充養老保險費、補充醫療保險費，在國務院財政、稅務主管部門規定的范圍和標準內，準予扣除。

《財政部、國家稅務總局關于補充養老保險費補充醫療保險費有關企業所得稅政策問題的通知》(財稅〔2009〕27號)規定，自2008年1月1日起，企業根據國家有關政策規定，為在本企業任職或者受雇的全體員工支付的補充養老保險費、補充醫療保險費，分別在不超過職工工資總額5%標準內的部分，在計算應納稅所得額時準予扣除;超過的部分，不予扣除。

因此，你公司為本企業任職或受雇的全體員工支付的補充養老保險費、補充醫療保險費，應分別在不超過職工工資總額5%標準內的部分，準予扣除，超過限額標準的應作納稅調整。具體來說，補充養老保險扣除限額=200×5%=10(萬元)，實際發生了12萬元，需要調增應納稅所得額=12-10=2(萬元);補充醫療保險扣除限額=200×5%=10(萬元)，實際發生了8萬元，可以全額扣除。