云南中醫學院成立于1960年，是全國第二批成立的高等中醫藥本科院校， 1986年獲碩士學位授予權，2007年獲教育部本科教學水平評估“優秀”，2009年確定為省級立項建設博士授權單位，2013年、2015年中醫學、中藥學專業分別通過教育部認證，成為云南省政府與國家中醫藥管理局共建高校。學校秉承“崇德和合，博學敦行”的校訓精神，已發展成為以本科教育為主，研究生教育穩步發展，對外教育態勢良好；中醫藥為主體，民族醫藥特色鮮明，醫、理、工、管多學科協調發展的應用型綜合性中醫藥院校。

學校有呈貢、白塔兩個校區，占地面積800余畝，總建筑面積40余萬?。有紙質圖書資源95.49萬冊，線裝古籍圖書1.8萬冊，中外文數據庫46個。

截止2017年5月，有全日制學生10555人，其中，本科生9642人，研究生853人，留學生60人。有11個二級學院、1個公共課教學部；17個國家中醫藥管理局重點學科、14個省級重點學科，4個一級學科（涵蓋24個二級學科）碩士點，4個碩士專業學位點；有21個本科專業，其中，國家級特色專業2個、綜合改革試點專業1個，省級重點、特色專業各5個、綜合改革試點專業3個；省級及以上教學質量工程項目194項。

有教職工800余人,學歷、學緣、職稱結構合理。有碩士生導師262人，博士生導師17人。有享受國務院政府特殊津貼專家4人、有國家突出貢獻中青年專家1人、全國中醫藥高等學校教學名師1人，云南省突出貢獻優秀專業技術人才7人、教學名師8人、國醫名師4人、名中醫36人、榮譽名中醫34人，云嶺學者1人、云嶺名師1人、云嶺名醫3人、云嶺產業技術領軍人才1人，享受云南省政府特殊津貼專家9人，云南省中青年學術與技術帶頭人8人、技術創新人才1人、中醫藥高層次人才及培養對象5人、中青年學術與技術帶頭人后備人才4人、技術創新人才培養對象1人。

57年來，幾代名醫名家傾囊相授，潛心育人，培養了6萬余名中醫藥專門人才，有的植根云嶺，造福桑梓，有的遠涉重洋，光大中醫，涌現出國家科技進步一等獎、何梁何利獎獲得者朱兆云；旅法中醫專家、時空針灸創始人、法國榮譽軍團騎士勛章獲得者朱勉生；軍中國醫名師寧亞功；中國中醫科學院首席研究員、廣安門醫院院長王階；全國民族團結進步先進個人陳本善；中國人民大學教授、教育部高校思想政治理論課教師、度影響力標兵人物王向明等一大批享譽國內外的杰出校友。

學校建有世界唯一的中醫西學博物館；西學中醫漢文化國際推廣研究基地已通過孔子學院總部、國家漢辦專家論證；校內建有的云南省中醫藥民族醫藥博物館，是國家中醫藥文化宣傳教育基地、云南省科普教育基地；學校是云南省中醫藥國際教育基地、國際科技合作基地、云南省民族醫藥保護與產業發展研究基地。是云南省生物醫藥和大健康產業推進組主要成員單位，中國工程院重點項目《云南生物醫藥和大健康產業發展戰略及措施研究》咨詢項目副組長單位，云南省優勢中藥材規范化種植工程研究中心主要成員單位，國家教育信息化試點單位。有省級重點實驗室、工程技術研究中心、中醫藥臨床評價研究中心，工程實驗室、公共科技服務平臺、創新團隊各1個，有國家中醫藥管理局中醫藥科研三級實驗室2個，院士專家工作站7個，院士工作站站點1個，省級2011協同創新中心2個，省級中醫臨床研究基地1個，省哲學社會科學研究基地1個，省技術轉移示范機構1個，省級高校重點實驗室和工程中心8個，省級高校科技創新團隊4個；實踐教學基地129個，其中，直屬附屬醫院2所，非直屬附屬醫院11所，藥學類合作基地54個。

學校聚焦民族醫藥、滇南醫藥、南藥研究三大科研集群，推進校政、校校、校地、校企合作，打造“保健品化妝品第三方檢測、臨床評價研究、健康產品研發、中醫藥知識產權戰略運營中心”四大平臺，彌補云南生物醫藥和大健康產業科研平臺短板。與省藥監局共建云南省中醫藥產業發展研究院、與省科技廳共同設立“中醫藥聯合專項基金”，是云南省中醫藥政策研究中心，中國中醫科學院中醫藥數據中心云南分中心、云南省中醫藥數據中心。與云南能源投資集團實行全面戰略合作，與云南呦陽生物科技公司共建“云南道地中藥材種苗繁育基地”，與上海中醫藥大學和昭通、普洱、麗江等地方政府簽訂戰略合作協議。

近三年，學校獲國家級科研項目53項，省部級科研項目168項，年均科研經費 3399萬元；獲省部級科研成果獎19項，其中,一等獎4項、二等獎6項。近兩屆獲省級教學成果獎一等獎4項、二等獎4項。78級校友、特聘教授、碩士生導師朱兆云領銜、學校趙毅、韋群輝2位教授參與的“低緯高原地區天然藥物資源野外調查與研究開發”重大項目，獲2012年度國家科學技術進步獎一等獎。

近年來，畢業生年終就業率平均為97.8%，學生在全國、全省各類學科競賽、專業技能競賽中獲國家級獎項46項，省級獎項109項。2013年開始實施的“本科畢業生德育答辯制度”思想政治教育探索實踐，獲第三屆云南省宣傳思想文化工作創新獎。“讀經典、學經典、用經典”活動已經成為書香云中、健康云中建設的品牌。

學校早在1990年就代表中國與西班牙合作辦學，建立了“加泰羅尼亞-云南中醫學院”，被載入全國中醫藥高等教育60年史冊；從2007年發起并主辦七屆“大湄公河次區域傳統醫藥交流會”，2015年在老撾開設“中醫教育培訓中心”，成立“瀾滄江?湄公河傳統醫藥學院”，舉辦首屆瀾滄江?湄公河傳統醫藥學術交流暨首屆國際佤醫藥發展交流會。先后與美國、澳大利亞、法國、德國、加拿大、瑞士、韓國、泰國、越南、印尼及港臺等30多個國家或地區建立了交流合作關系，共培養留學生2133人。學校已成為面向南亞、東南亞區域最有影響力的國際傳統醫藥教育交流合作平臺。

欣逢盛世，中醫藥迎來了天時、地利、人和的大好發展時機，中醫藥上升為國家戰略，生物醫藥和大健康產業成為云南省八大重點推進產業之首，國家批準設立中國昆明大健康產業示范區、建設國家植物博物館。學校將謀勢而動，乘勢而為，主動融入“一帶一路”、健康中國等國家戰略，圍繞云南三大戰略定位，服務云南經濟社會發展，推進特色鮮明高水平中醫藥大學建設。