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學校占地面積約100畝，有60個教學班，在校學生約3080人。學校綠樹成蔭，湖光掩映，素有“校風好、學風濃”的美稱。學校擁有一支師德高尚、教風嚴謹、業務精湛的教師隊伍，其中在職全國名校長、廣州市名校長、番禺區首屆名校長1人，廣州市勞動模范2人，特級教師2人，廣東省名師工作室主持人1人，廣州市名師工作室主持人3人；高級教師122人，一級教師93人。碩士研究生學歷58人，南粵優秀教師（教壇新秀 ）7人，廣州市名教師3人，廣州市道德模范1人，番禺名教師6人，全國先進工作者和省市區優秀教師一大批；廣州市高考研究組成員、市區兩級學科中心組成員、特約教研員、學科研究會理事等41人。一批教學骨干常年活躍在國家、省、市各學科的專業學術團體活動中，參與廣州市中考、高中學業水平測試、廣東省高考的命題工作，成為頗具影響的名師、專家。

歷年高考重點率、高分人數、各科平均分，穩居廣州市、廣東省前列。2000年以來先后有21人成為高考總分和單科廣東省狀元。自1996年起連續十八年獲廣州市高三畢業班工作綜合評比一等獎，其中2007、2008、2010、2011和均獲廣州市一等獎總分第1名，2012和2013年獲廣州市一等獎總分第2名；2000年郭志勇同學獲全國高考廣東省化學科狀元，2001年彭炎聰同學獲全國高考廣東省化學科狀元，2004年梁妍鈺同學獲全國高考廣東省語文科狀元，2005年梁燁妮同學獲全國高考廣東省語文科狀元，2007年顏暉皓同學獲全國高考廣東省化學類五科總分狀元，2008年陳德健、何暢、梁勝仔三位同學分別獲得物理、歷史、理科綜合廣州市單科第一名，有十一位同學位列廣州市各單科的前十名。2009年郭宇成等14位同學以150分滿分獲得廣東省理科基礎第一名，位列省市前茅。2010年高考，再次改寫番禺高考的輝煌歷史，周于敬同學以709分勇奪全國高考廣東省理科總分狀元，被清華大學建筑設計學院優先錄取。李杰鋒同學理科綜合287分、陳樂同學語文137分，位居廣東省前列。2015年高考，我校各批次特別是重點本科上線人數實現新突破，重點本科上線人數643人，位居廣州市各高中之首，比廣州市重本預測540人多103人，重本上線率65.43%，位居廣州市各區屬高中之首，重本率比去年增加6個百分點；本科A上線人數942人，上線率達93%，本科B上線人數990人，上線率97.22%，均創歷史新高。

學校堅持特色立校、科研興校、質量強校，以科研為引領，以課程為平臺，以社團為依托，以培優為磨煉，全面實行素質教育。近年還積極探索，大膽創新，率先進行“研學后教”之“五環學習法”模式的課堂教學改革，學生小組圍桌上課，自主學習、教師點撥和課堂展示相結合，徹底改變傳統“滿堂灌”的教學模式，實現“以師為本、以教為主”向“以生為本、以學為主”的轉變，真正做到“把時間還給學生，把方法教給學生，把機會讓給學生”。近五年學生參加各類競賽獲國際級和國家、省市級獎項超過400人次，其中鐘逸嶠、陶葉帆、梁子彬和莫梓亮等同學榮獲全國數學、化學競賽一等獎；袁健進同學代表國家隊參加廣州第16屆亞運會速度輪滑比賽，獲亞洲第五名。學生社團“模擬聯合國、校園電視臺、辯論社、義工隊、銀杏文學社、動漫社、擊劍隊、定向運動社、合唱隊、舞蹈隊”等在國內國際各類比賽中獲得眾多獎項。仲元作為新課程實驗的省級樣本校，除了高質量開齊開好國家必修課程選修課堂外，還開發近20余門校本選修課程以及廣州市立項的特色課程《君子之風教育》，為全體學生的個性化發展服務。

由于辦學成績顯著，學校先后評為首批廣東省一級學校，首批廣東省國家級示范性普通高中，2005至2015年連續六屆評為“中國百強中學”，“全國名優學校”、“廣東省普教系統先進單位”、“全國體育傳統項目先進學校”、“廣東省群眾體育先進單位”、“廣東省依法治校示范校”、“廣東省綠色學校”、“廣州市文明單位”、“廣東省中小學校本培訓示范學校”、“北京2008奧林匹克教育示范學校”、“廣州市創先爭優先進基層黨組織”、“廣州市番禺區五一勞動獎狀”、“全國消防安全教育示范學校”等榮譽稱號。