仲愷農業工程學院排名2016排行第509名，相較于2015年的排行第506名，排名下降了3位。
仲愷農業工程學院歷年排名
| 年度 | 全國排名 | 省內排名 | 總分 |
| 2017 | 495 | 24 | 60.32 |
| 2016 | 509 | 25 | 60.47 |
| 2015 | 506 | 23 | 60.48 |
| 2013 | 438 | 14 | 60.07 |
仲愷農業工程學院在廣東省排名情況
| 廣東省大學排名 | 學校名稱 | 學校類型 |
| 1 | 中山大學 | 綜合 |
| 2 | 華南理工大學 | 理工 |
| 3 | 華南師范大學 | 師范 |
| 4 | 暨南大學 | 綜合 |
| 5 | 深圳大學 | 綜合 |
| 6 | 華南農業大學 | 農林 |
| 7 | 南方醫科大學 | 醫藥 |
| 8 | 汕頭大學 | 綜合 |
| 9 | 廣東外語外貿大學 | 語言 |
| 10 | 廣州大學 | 綜合 |
| 11 | 廣東工業大學 | 理工 |
| 12 | 廣州中醫藥大學 | 醫藥 |
| 13 | 東莞理工學院 | 理工 |
| 14 | 廣州醫科大學 | 醫藥 |
| 15 | 廣東財經大學 | 財經 |
| 16 | 廣東技術師范學院 | 師范 |
| 17 | 廣東海洋大學 | 農林 |
| 18 | 廣東金融學院 | 財經 |
| 18 | 廣東藥科大學 | 醫藥 |
| 20 | 廣東醫科大學 | 醫藥 |
| 20 | 五邑大學 | 綜合 |
| 22 | 韶關學院 | 綜合 |
| 23 | 嘉應學院 | 綜合 |
| 24 | 廣東石油化工學院 | 理工 |
| 24 | 韓山師范學院 | 師范 |
| 24 | 惠州學院 | 綜合 |
| 24 | 仲愷農業工程學院 | 農林 |
| 28 | 佛山科學技術學院 | 綜合 |
| 29 | 肇慶學院 | 綜合 |
| 30 | 廣東第二師范學院 | 師范 |
| 31 | 廣州航海學院 | 理工 |
| 32 | 嶺南師范學院 | 師范 |
