福建中醫藥大學2017年位列361名，相較于2015年的排行第335名，排名下降了26位。
福建中醫藥大學歷年排名

年份	全國排名	總分排名	科學研究	人才培養	聲譽排名
2015	335	60.89	60.89	60.89	60.89
2014	329	61.55	60.31	63.04	60.16
2013	296	60.26	0.92	0.46	0.31
2012	322	0.49	0.68	0.42	0.03
2011	373	0.24	0.03	0.47	0.11
2010	375	0.25	0.03	0.47	0.29
2009	386	0.24	0.03	0.44	0.25

福建中醫藥大學原名福建中醫學院，創建于1958年，是中國創辦較早的高等中醫藥院校之一，2003年成為福建省重點建設高校8所之一，2010年3月經教育部批準更名為福建中醫藥大學。學校占地面積近1200畝，其中旗山校區占地面積935畝，屏山校區占地面積161畝。
截至2013年10月，學校有教職員工2700多人，在校生近1萬人；設有13個學院，兩個研究院。學校與美國、德國、澳大利亞、日本、馬來西亞、臺灣、香港等國家和地區的高等院校、科研醫療機構、學術團體建立了穩定的合作關系。