南通大學比較好的專業有：

自動化、生物技術、機械設計制造及其自動化、電子商務、土木工程、教育技術學、思想政治教育、紡織工程。

南通大學招生的專業有：

自動化專業
生物技術專業
機械設計制造及其自動化專業
電子商務專業
土木工程專業
教育技術學專業
思想政治教育專業

紡織工程專業
電子信息科學與技術專業
電氣工程與自動化專業
護理學專業
化學工程與工藝專業
工商管理類專業
計算機科學與技術專業
藥學專業
國際經濟與貿易專業
應用化學專業
數學與應用數學專業
網絡工程專業
光信息科學與技術專業

漢語言文學專業
醫學檢驗專業
資源環境與城鄉規劃管理專業
物理學專業
醫學信息學專業
廣播電視新聞學專業
集成電路設計與集成系統專業
工程管理專業
通信工程專業
預防醫學專業
市場營銷專業
生物科學類專業
工業設計專業
物流管理專業
地理信息系統專業
信息管理與信息系統專業
旅游管理專業
化學專業
社會工作專業
學前教育專業

地理科學專業
軟件工程專業
臨床醫學專業
電子科學與技術專業
建筑學專業
機械工程及自動化專業
信息與計算科學專業
工商管理專業
輕化工程專業
人力資源管理專業
行政管理專業
康復治療學專業
應用物理學專業
醫學影像學專業
公共事業管理專業
歷史學專業
應用心理學專業
會計學專業
環境工程專業
生物科學專業

英語專業
口腔醫學專業
測控技術與儀器專業
電氣信息類專業
高分子材料與工程專業
教育學專業
日語專業
環境科學專業
服裝設計與工程專業
非織造材料與工程專業
統計學專業
電子信息工程專業