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南京中醫藥大學翰林學院是2005年5月經教育部批準設立的獨立學院，其前身是2002年3月由江蘇省教育廳批準成立的南京中醫藥大學公有民辦二級學院。自2010年起，南京中醫藥大學翰林學院移址素有“文昌水秀，祥泰之州”之譽的蘇中歷史名城泰州市,坐落在中國醫藥城內（江蘇省泰州市學院路6號）辦學。校園依湖而建，建筑新穎、環境優美、景色怡人，學術氛圍濃厚。校內各項教學、實驗及生活設施先進齊全，是莘莘學子理想的學習深造場所。

學院建設了一支以南京中醫藥大學教師為骨干，專兼職相結合、教學水平高的優秀師資隊伍。從2002年起開始招生，辦學層次為全日制普通本科，現有在讀學生近5000人，共培養十余屆畢業生。學院立足泰州，輻射長三角，面向全國，以市場需求為依據、以就業為導向。根據學校的總體規劃和學院的發展目標以及社會的需求，開設有中醫學、針灸推拿學、護理學、應用心理學中藥學、藥事管理、藥學、藥物制劑、制藥工程、中藥資源與開發、公共事業管理(衛生事業管理)、公共事業管理（醫療保險）、國際經濟與貿易、市場營銷、信息管理與信息系統15個本科專業。學院依托南京中醫藥大學的雄厚師資，共享南京中醫藥大學的教學資源。畢業生可以和南京中醫藥大學的在校生一樣攻讀更高一級學位。