學校創辦于1934年，時名湖南國醫專科學校，1960年改辦為普通高等本科院校湖南中醫學院，1990年原湖南科技大學成建制并入湖南中醫學院，2002年湖南省中醫藥研究院與湖南中醫學院合并，2006年經教育部批準更名為湖南中醫藥大學。2012年學校進入一本招生序列。目前學校與湖南省中醫藥研究院實行校院合一的管理體制。
學校現有含浦、東塘2個校區，總占地面積1000余畝，校舍建筑面積47萬平方米。現有3所直屬附屬醫院，13所非直屬附屬醫院，5個校辦合資企業。學校下設17個學院、16個研究中心（所）。學校現有學生總人數46006人，其中研究生1843人、全日制本科生18339人、專科生189人、成人學歷教育學生22222人、境外學生407人。學校圖書館藏書109.7萬冊，線裝古籍2.5萬余冊。擁有教學科研儀器設備總值1.50億元，有40萬元以上的貴重儀器設備17臺件、多媒體教室165間，建成了先進的校園網絡和多媒體教學、教室監控、教學廣播、會議視頻、屏蔽系統。
學校始終把提高教學質量作為第一要務來抓，不斷創新教育理念，優化專業結構，深化教學內容、課程體系與實踐教學改革，強化中醫本科人才臨床（診療）思維和實踐能力的培養，實施了農村訂單定向免費醫學生（中醫學）培養項目，實施了臨床型拔尖中醫人才培養體制的構建與實踐改革試點項目，大力推進素質教育，取得了顯著成效。目前，學校開設24個本科專業，分屬于醫學、理學、工學、管理學、文學5個學科門類。現有4個國家級特色專業建設點，7個省級特色專業建設點；國家級本科專業綜合改革試點1個，省級本科專業綜合改革試點2個。學校現有國家級精品課程1門，國家級精品資源共享課1門，省級精品課程9門。學校歷來重視人才培養工作，本科生參與課外科技活動的普及率不斷增高，獲得各類國家級、省級學科和科技競賽獎百余項，近3年本科畢業生年終就業率平均為96.5%，位居全省高校前列。
學校構建了以醫學學科為主體，醫、理、工、管、文等學科門類協調發展的學科體系。擁有中醫學、中西醫結合2個博士后科研流動站。現有一級學科博士學位授權點1個，二級學科博士學位授權點22個，其中8個二級學科自主設置博士學位授權點；一級學科碩士學位授權點4個，二級學科碩士學位授權點41個，其中17個二級學科自主設置碩士學位授權點。
學校形成了國家、省、學校三級重點學科體系，基本實現了湖南省建設教育強省規劃中對高校重點學科建設的要求，并形成了鮮明的中醫藥學科特色與優勢。有國家重點學科1個，國家中醫藥管理局重點學科23個，湖南省重點學科10個，其中湖南省優勢特色重點學科2個。中醫診斷學在本學科研究領域居國內領先水平。學校的優勢科研項目有病證診療標準化與客觀化研究，中藥超微技術與創新藥物研究，針灸??經絡原理研究，婦科血癥研究，中藥材育種、栽培、管理、標準化研究，心腦血管病、肝病、腫瘤、糖尿病、眼底病、免疫性疾病等疑難重大疾病的防治研究，并打造了相應的科技創新團隊。
學校建設了一支結構合理、素質高、富有創新精神的師資隊伍。現有在職教職工1876人，其中專任教師和實驗室人員1254人；具有正高職稱教師211人、副高職稱教師302人；有博士生導師108人、碩士生導師422人。有國家有突出貢獻的中青年專家4人，衛生部有突出貢獻的中青年專家2人，衛生部先進工作者1人，享受國務院政府特殊津貼的專家59人，享受省政府特殊津貼的專家2人，國家“百千萬人才工程”國家級人選1人，國家級優秀教師2人。湖南省“121人才工程”第一層次人選4人，湖南省高層次衛生人才“
學校注重科技平臺的建設，建設有國家級3個、部級21個、省級14個、廳級13個。其中，有國家重點實驗室培育基地1個、國家中醫（肝病）臨床研究基地1個、國家發改委工程實驗室1個；教育部工程研究中心1個、重點實驗室1個，國家中醫藥管理局重點研究室2個、國家中醫藥管理局三級中醫藥科研實驗室11個、國家中醫藥管理局二級中醫藥科研實驗室6個，國家中醫藥管理局中醫藥基地1個；湖南省2011協同創新中心1個、湖南省重點實驗室3個、湖南省工程技術中心3個、湖南省特色創新服務平臺1個、湖南省工程實驗室2個，湖南省中醫藥文化研究基地1個、思想政治工作研究基地1個；湖南省普通高等學校重點實驗室6個、湖南省中醫藥管理局重點研究室5個。有SPF級實驗動物中心1個、國家級科普基地5個。所有科技實驗平臺實行校院兩級管理，對全校學生預約開放。
目前學校有在研課題688項，縱向在研科研經費6600余萬元，參與973計劃項目14項、863計劃項目4項，獲批國家科技重大專項4項、國家重大新藥創制2項、國家科技支撐計劃項目10項、國家自然科學基金課題104項、國際合作專項2項。2000年至今，學校共獲國家級及省部級科技成果獎106項，其中“中藥超微粉體關鍵技術研究及產業化”成果于2009年獲國家科技進步二等獎。開發中藥新藥51個，獲科技成果轉讓84項、國家專利205項、科技開發和新藥轉讓費9958.3萬元。學校有直屬附屬醫院3所，非直屬附屬醫院12所，共有病床14789張。第一附屬醫院被列為國家中醫臨床研究基地建設單位，第二附屬醫院被列為全國重點建設中醫院，附屬中西醫結合醫院為十所全國重點建設中西醫結合醫院之一。附屬醫院醫療設施先進，臨床科室設置齊全，擁有一批知名的中醫臨床專家。擁有肝病、眼底病、皮膚瘡瘍病、肛腸病、兒科、骨傷科、不孕不育科、心血管內科、針灸科、腦病、腫瘤等11個國家重點中醫專科（專病）中心。有國家藥品臨床研究基地3個。
學校積極開展國際交流與合作，拓展外部發展空間。我校為全國高等中醫藥院校中首批招收港澳臺及外國留學生的單位，2009年獲批為國家中醫藥管理局中醫藥國際合作基地。現有在籍留學生和港澳臺僑學生373人。中國湖南國際針灸培訓中心設于我校，已為30個國家和地區培訓了千余名多名學員。1990年以來，學校先后多次選派專家、教授赴英國等20多個國家和地區留學訪問，并派出數批醫療隊赴俄羅斯等多個國家防病治病。與美國新英格蘭中醫學院、加拿大中央學院、香港大學、澳門科技大學、新加坡中醫學院、日本青葉札幌等建立了醫療、教學、科研合作關系；與馬來西亞林肯大學開展境外合作辦學項目，成為我省首個境外合作辦學項目。獲批與韓國圓光大學共建孔子學院。
近年來，學校辦學條件不斷改善，辦學規模穩步擴大，教學質量穩步提高，科研水平大幅上升，醫療服務水平不斷提高，產業發展勢頭良好，已發展成為一所以本科教育為主、具有完整高等教育辦學層次和多個學科門類、多種辦學形式、辦學綜合實力較強的高等中醫藥院校。
