哈爾濱工程大學2017年排行第63名，相較于2017年的排行第57名，排名下降了6位。
哈爾濱工程大學歷年排名情況
| 年度 | 全國排名 | 省內排名 | 總分 |
| 2017 | 63 | 2 | 63.67 |
| 2016 | 57 | 2 | 65.41 |
| 2015 | 48 | 2 | 65.91 |
| 2014 | 57 | 2 | 64.9 |
| 2013 | 65 | 2 | 63.22 |
哈爾濱工程大學在黑龍江省排名情況
| 黑龍江省大學排名 | 學校名稱 | 學校類型 |
| 1 | 哈爾濱工業大學 | 理工 |
| 2 | 哈爾濱工程大學 | 理工 |
| 3 | 東北林業大學 | 農林 |
| 4 | 黑龍江大學 | 綜合 |
| 5 | 哈爾濱醫科大學 | 醫藥 |
| 6 | 東北農業大學 | 農林 |
| 7 | 哈爾濱理工大學 | 理工 |
| 8 | 哈爾濱師范大學 | 師范 |
| 9 | 東北石油大學 | 理工 |
| 10 | 黑龍江中醫藥大學 | 醫藥 |
| 11 | 哈爾濱商業大學 | 財經 |
| 12 | 黑龍江科技大學 | 理工 |
| 13 | 齊齊哈爾大學 | 綜合 |
| 14 | 黑龍江八一農墾大學 | 農林 |
| 15 | 佳木斯大學 | 綜合 |
| 16 | 黑龍江工程學院 | 理工 |
| 17 | 牡丹江師范學院 | 師范 |
| 17 | 綏化學院 | 綜合 |
| 19 | 牡丹江醫學院 | 醫藥 |
| 20 | 哈爾濱金融學院 | 財經 |
| 20 | 黑龍江工業學院 | 理工 |
| 22 | 黑河學院 | 綜合 |
| 22 | 齊齊哈爾醫學院 | 醫藥 |
| 24 | 大慶師范學院 | 綜合 |
| 25 | 哈爾濱學院 | 綜合 |
