齊齊哈爾工程學院的前身，是成立于1958年的齊齊哈爾第一機床廠重型機床制造學院，文革前實施六年制（業余）本科和四年制(業余)專科教育，其間易名為齊齊哈爾第一機床廠“七?二一”工人大學、齊齊哈爾第一機床廠職工機電學院。

1993年，學校為支持國有企業公司化改造與企業簽訂經濟分離合同，成為全國第一家國企學校與企業分離的典型,易名為黑龍江東亞大學。2001年，省政府批準在黑龍江東亞大學基礎上成立齊齊哈爾職業學院，結束了齊齊哈爾市沒有地方普通高校的歷史。2011年4月，教育部批準齊齊哈爾職業學院升格更名為齊齊哈爾工程學院，學院屬本科層次的普通高校，隸屬齊齊哈爾市人民政府。

經省教育廳核準，我院2005屆畢業生初次就業率94.87%，2006屆畢業生初次就業率95.81%，我院2007屆畢業生初次就業率92.58%，位居全省同類院校前列。