牡丹江有牡丹江醫學院、牡丹江師范學院、牡丹江大學、黑龍江林業職業技術學院、黑龍江農業經濟職業學院、黑龍江商業職業學院、黑龍江幼兒師范高等專科學校等7所大學，其中本科學校2所，專科學校5所，具體完整名單見下表。

一、2024年牡丹江所有大學名單一覽表

二、牡丹江市大學最新排名

三、牡丹江部分大學推薦

1、牡丹江師范學院

牡丹江師范學院（Mudanjiang Normal University），簡稱牡師院，位于牡丹江市，是國家級語言文字規范化示范校、黑龍江省東南部地區教師教育研究中心、基礎教育研究中心和繼續教育培訓中心、黑龍江省對俄經貿人才培養基地。

牡丹江師范學院始建于1958年，歷經東北農學院嫩江分院、北安師范專科學校、寧安師范專科學校、牡丹江師范學院等發展階段。1995年9月，學校遷入牡丹江市。2006年，學校被批準為碩士學位授予單位。

2、牡丹江醫學院

牡丹江醫學院位于黑龍江省牡丹江市，是黑龍江省屬普通本科醫藥院校，是黑龍江省特色應用型本科高校建設單位、中國全國首批卓越醫生教育培訓計劃項目試點高校，2015年在教育部臨床醫學專業認證中獲得了6年有效期。

學校由1946年始建的牡丹江專區醫院、1956年始建的黑龍江省衛生干部進修學校于1958年共同創建，歷經了牡丹江醫學院（1958—1962年）、牡丹江衛生學校（1962—1978年）、牡丹江醫學專科學校（1978—1986年）、牡丹江醫學院（1986年—）等歷史時期，2013年獲得碩士學位授予權。

3、黑龍江農業經濟職業學院

黑龍江農業經濟職業學院（HeiLongJiang Agricultural Economy Vocational College），是經省政府批準、教育部備案、面向全國招生的公辦全日制綜合性普通高等學校，是國家示范性高等職業院校、第二批國家現代學徒制試點單位、”*高水平高職學校和專業建設計劃“建設高校。

學院始建于1958年，前身是東北農學院牡丹江分院，本科建制；1962年轉設為中專；2002年2月經省政府批準，成立黑龍江農業經濟職業學院。2008年，學校被財政部、教育部確立為國家示范性高等職業院校建設單位。2016年8月，入選第二批國家現代學徒制試點單位。2019年12月，被教育部、財政部列入第三類高水平專業群建設單位（A檔）。