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遵義醫科大學創建于1947年，曾用關東醫學院、大連大學醫學院、大連醫學院等名稱。1969年為支援“三線”建設，學校整體搬遷至貴州省遵義市，更名為遵義醫學院。2018年更名為遵義醫科大學，2021年獲批博士學位授予單位。

經過多年的建設與發展，已成為以醫學為主、多學科支撐、辦學特色鮮明、辦學實力雄厚的省屬重點高校，是國家衛生健康委員會與貴州省人民政府共建高校、國家中西部高校基礎能力建設工程高校、國家首批卓越醫生教育培養計劃項目試點高校、國家首批臨床醫學碩士專業學位研究生培養模式改革試點高校。

學校從1955年開始招收研究生，是1981年恢復高考后全國首批碩士學位授權單位。1999年起與重慶醫科大學、上海交通大學等高校聯合培養博士研究生。

學校高度重視對外交流合作與國際化教育，與遵義市、珠海市簽訂合作協議，合作建設大學科技園、貴州醫藥大健康產業研究院、珠海金灣醫藥產業研究院等科技成果轉化平臺，積極推進科技成果轉化和服務地方發展；與浙江大學、澳門科技大學等國（境）內外高水平大學開展深度合作，推進協同育人；與茅臺集團等大型企業開展科技創新、人才培養、醫療衛生等方面的合作，實現校企共贏。