1內蒙古自治區最佳大學排行榜在內蒙古自治區最佳高校排行榜中，內蒙古大學蟬聯榜首，內蒙古農業大學居第2，內蒙古師范大學列第3，內蒙古工業大學居第4，內蒙古科技大學列第5。全部排名數據請看下表：
| 本省排名 | 學校名稱 | 城市 | 全國排名 | 總分 | 星級 |
| 1 | 內蒙古大學 | 呼和浩特市 | 106 | 63.22 | 3星級 |
| 2 | 內蒙古農業大學 | 呼和浩特市 | 194 | 61.76 | 2星級 |
| 3 | 內蒙古師范大學 | 呼和浩特市 | 218 | 61.52 | 2星級 |
| 4 | 內蒙古工業大學 | 呼和浩特市 | 251 | 61.36 | 2星級 |
| 5 | 內蒙古科技大學 | 包頭市 | 292 | 61.12 | 1星級 |
| 6 | 內蒙古民族大學 | 通遼市 | 350 | 60.88 | 1星級 |
| 7 | 內蒙古醫科大學 | 呼和浩特市 | 375 | 60.78 | 1星級 |
| 8 | 內蒙古財經大學 | 呼和浩特市 | 406 | 60.65 | 1星級 |
| 9 | 赤峰學院 | 赤峰市 | 518 | 60.46 | 1星級 |
| 10 | 集寧師范學院 | 烏蘭察布市 | 573 | 60.39 | 1星級 |
| 11 | 呼倫貝爾學院 | 呼倫貝爾市 | 620 | 60.34 | 1星級 |
| 12 | 河套學院 | 巴彥淖爾市 | 699 | 60.23 | 1星級 |
| 13 | 呼和浩特民族學院 | 呼和浩特市 | 710 | 60.01 | 1星級 |
| 14 | 鄂爾多斯應用技術學院 | 鄂爾多斯市 | 711 | 60 | 1星級 |
| 內蒙古藝術學院 | 呼和浩特市 | 2星級 |
2內蒙古自治區獨立學院排行榜在內蒙古自治區最佳獨立學院排行榜中，內蒙古大學創業學院問鼎2016內蒙古自治區最佳獨立學院排行榜榜首，全國排名第239，內蒙古師范大學鴻德學院列第2。
| 本省排名 | 學校名稱 | 城市 | 全國排名 | 總分 | 星級 |
| 1 | 內蒙古大學創業學院 | 呼和浩特市 | 239 | 76.01 | 1星級 |
| 2 | 內蒙古師范大學鴻德學院 | 呼和浩特市 | 265 | 73.43 | 1星級 |
