電氣工程及其自動化：
專業雖然起步較晚，但是發展十分迅速，且前景很好，擁有航空電源航空科技重點實驗室，建立了中航一集團和中航二集團技術工程中心，相關研究領域在國內也具有重要影響力。本專業與自動化專業一起共建為江蘇省特色本科專業。
飛行器設計：
是南京航天大學最著名的專業，也是歷年學校招聘會上最受矚目的熱門專業，建有我國直升機技術研究方向唯一的國家級(國防)重點實驗室“直升機旋翼動力學實驗室”，建有國內唯一專門從事航空智能材料與結構研究的航空重點實驗室以及CAD中心、結構振動兩個部門開放實驗室，實驗室面積總共達14800多平方米。實驗設備總值達15600多萬元，成為我國航空航天科技研究和高層次人才培養的重要基地。
飛行員專業：
是這個學校最牛的專業，學校與多家航空公司聯合，對學生實行訂單式培養方式，共有“31”和“22”兩種招生模式，采取國內國外兩部教學，如“31”就是學員前三年在國內校本部進行飛行專業基礎理論知識學習和基本技能訓練，第四學年派送到國外飛行學校進行為期一年的飛行訓練，并取得中國民航總局認可的符合多發儀表等級要求的國外商業飛行員駕駛執照。蘇州大學重點優勢專業介紹 南京大學優勢特設專業介紹 東南大學重點優勢專業介紹 南開大學重點優勢專業介紹 內蒙古大學重點優勢專業介紹 中國地質大學(北京)重點優勢專業介紹 中國政法大學重點優勢專業介紹 北京外國語大學重點優勢專業介紹 中央財經大學重點優勢專業介紹 中國傳媒大學重點優勢專業介紹 北京林業大學重點優勢專業介紹 北京郵電大學重點優勢專業介紹 中央名族大學重點優勢專業介紹 北京航空航天大學重點優勢專業介紹 北京科技大學重點優勢專業介紹