南京市內比較好的本科大學名單有：南京大學、東南大學、南京航空航天大學、南京理工大學、南京工業大學、南京郵電大學、河海大學、南京林業大學、南京信息工程大學、南京農業大學、南京醫科大學、南京中醫藥大學、中國藥科大學、南京師范大學、南京財經大學、江蘇警官學院。
一、南京市內本科學校的一覽表
| 序號 | 學校名稱 | 主管部門 | 所在地 | 辦學層次 | 備注 |
| 1 | 南京大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 2 | 東南大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 3 | 南京航空航天大學 | 工業和信息化部 | 南京市 | 本科 | |
| 4 | 南京理工大學 | 工業和信息化部 | 南京市 | 本科 | |
| 5 | 南京工業大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 6 | 南京郵電大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 7 | 河海大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 8 | 南京林業大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 9 | 南京信息工程大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 10 | 南京農業大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 11 | 南京醫科大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 12 | 南京中醫藥大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 13 | 中國藥科大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | |
| 14 | 南京師范大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 15 | 南京財經大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 16 | 江蘇警官學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 17 | 南京體育學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 18 | 南京藝術學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 19 | 南京工業職業技術大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 20 | 三江學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 21 | 南京工程學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 22 | 南京審計大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 23 | 南京曉莊學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 24 | 南京特殊教育師范學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 25 | 南京森林警察學院 | 公安部 | 南京市 | 本科 | |
| 26 | 東南大學成賢學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 27 | 金陵科技學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | |
| 28 | 南京大學金陵學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 29 | 南京理工大學紫金學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 30 | 南京航空航天大學金城學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 31 | 南京傳媒學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 32 | 南京工業大學浦江學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 33 | 南京審計大學金審學院 | 江蘇省教育廳 | 南京市 | 本科 | 民辦 |
| 34 | 江蘇第二師范學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 |
二、南京市內公辦本科大學名單一覽表
| 序號 | 學校名稱 | 主管部門 | 所在地 | 辦學層次 | 備注 |
| 1 | 南京大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 2 | 東南大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 3 | 南京航空航天大學 | 工業和信息化部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 4 | 南京理工大學 | 工業和信息化部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 5 | 南京工業大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 6 | 南京郵電大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 7 | 河海大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 8 | 南京林業大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 9 | 南京信息工程大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 10 | 南京農業大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 11 | 南京醫科大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 12 | 南京中醫藥大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 13 | 中國藥科大學 | 教育部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 14 | 南京師范大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 15 | 南京財經大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 16 | 江蘇警官學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 17 | 南京體育學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 18 | 南京藝術學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 19 | 南京工業職業技術大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 20 | 南京工程學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 21 | 南京審計大學 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 22 | 南京曉莊學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 23 | 南京特殊教育師范學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 24 | 南京森林警察學院 | 公安部 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 25 | 金陵科技學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
| 26 | 江蘇第二師范學院 | 江蘇省 | 南京市 | 本科 | 公辦 |
