| 學科門類 | 一級學科 | 星級排名 | 學科層次 | 學校名稱 |
| 理學 | 大氣科學 | 4星級 | 中國高水平研究生學科 | 云南大學 |
| 理學 | 地理學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南師范大學 |
| 理學 | 化學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南大學 |
| 理學 | 生態學 | 5星級 | 中國一流研究生學科 | 云南大學 |
| 理學 | 生態學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南師范大學 |
| 理學 | 生態學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 西南林業大學 |
| 理學 | 生物學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南大學 |
| 理學 | 數學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南大學 |
| 理學 | 數學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 昆明理工大學 |
| 理學 | 數學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南師范大學 |
| 理學 | 天文學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南師范大學 |
| 理學 | 統計學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南師范大學 |
| 理學 | 統計學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南財經大學 |
| 理學 | 物理學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南大學 |
| 理學 | 物理學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 昆明理工大學 |
| 理學 | 物理學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南師范大學 |
| 理學 | 系統科學 | 3星級 | 中國知名研究生學科 | 云南大學 |
