在最新的排名數據中，重慶醫科大學在2017全國大學排名中列于第 171 名，在2017重慶高校排名中列于第 4 名，重慶醫科大學屬于醫藥類大學，在2017醫藥類大學排名中列于第 11 名，以上數據僅指在全國所有公辦本科院校中的排名。
| 重慶醫科大學歷年排名表 | |||||
| 年度 | 全國排名 | 省內排名 | 分類 | 分類排名 | 總分 |
| 2017 | 171 | 4 | 醫藥 | 11 | 61.48 |
| 2016 | 159 | 4 | 醫科 | 10 | 62.16 |
| 2015 | 162 | 4 | 醫科 | 11 | 62.16 |
| 2014 | 126 | 4 | 醫科 | 10 | 62.80 |
| 2013 | 121 | 4 | 醫科 | 9 | 61.41 |
重慶醫科大學位于重慶市，那么在重慶市內，都有哪些大學最好，他們的排名各是多少？
| 學校名稱 | 全國排名 | 所在地區 | 地區排名 | 類型 | 類型排名 | 總分 |
| 重慶大學 | 31 | 重慶 | 1 | 綜合 | 18 | 67.22 |
| 西南大學 | 37 | 重慶 | 2 | 綜合 | 20 | 65.64 |
| 西南政法大學 | 131 | 重慶 | 3 | 政法 | 3 | 61.92 |
| 重慶醫科大學 | 171 | 重慶 | 4 | 醫藥 | 11 | 61.48 |
| 重慶郵電大學 | 180 | 重慶 | 5 | 理工 | 61 | 61.42 |
| 重慶交通大學 | 193 | 重慶 | 6 | 理工 | 68 | 61.31 |
| 重慶師范大學 | 240 | 重慶 | 7 | 師范 | 30 | 61.01 |
| 重慶工商大學 | 256 | 重慶 | 8 | 綜合 | 64 | 60.96 |
| 重慶理工大學 | 293 | 重慶 | 9 | 理工 | 109 | 60.81 |
| 重慶科技學院 | 391 | 重慶 | 10 | 理工 | 146 | 60.49 |
重慶醫科大學屬于醫藥類大學，那么在醫藥類大學中，都有哪些大學最好，他們的排名又各是多少？
| 學校名稱 | 全國排名 | 所在地區 | 地區排名 | 類型 | 類型排名 | 總分 |
| 北京協和醫學院 | 57 | 北京 | 10 | 醫藥 | 1 | 64.09 |
| 首都醫科大學 | 94 | 北京 | 19 | 醫藥 | 2 | 62.75 |
| 南方醫科大學 | 117 | 廣東 | 7 | 醫藥 | 3 | 62.33 |
| 天津醫科大學 | 121 | 天津 | 4 | 醫藥 | 4 | 62.18 |
| 中國藥科大學 | 122 | 江蘇 | 14 | 醫藥 | 5 | 62.13 |
| 北京中醫藥大學 | 123 | 北京 | 23 | 醫藥 | 6 | 62.06 |
| 哈爾濱醫科大學 | 127 | 黑龍江 | 5 | 醫藥 | 7 | 61.96 |
| 南京醫科大學 | 130 | 江蘇 | 16 | 醫藥 | 8 | 61.93 |
| 中國醫科大學 | 146 | 遼寧 | 6 | 醫藥 | 9 | 61.76 |
| 上海中醫藥大學 | 150 | 上海 | 11 | 醫藥 | 10 | 61.7 |
