重慶三峽醫藥高等專科學校于2006年2月經教育部批準設立，是在原重慶市萬州衛生學校與重慶市萬縣中醫藥學校合并基礎上組建而成。學校由重慶市人民政府舉辦，實行市區共建，以區為主的管理體制。學校占地面積608畝，校舍面積31萬平方米。學校于2005年在萬州區五橋建成新校區，投入建設資金2億元，占地面積520畝,校舍面積16萬平方米，職工宿舍7萬平方米，能滿足8000學生的學習和生活，基本建成在我市高職高專學校居于前列的環境優美的校園。現有館藏圖書36萬冊，教學儀器設備總值3200萬元，固定資產4.5億元。學校現有在校學生13000余人。在職職工556人，離退休職工194人。專任教師中正高級職稱9人，副高職稱121人，博士、碩士研究生72人，雙師型教師占75%。有76名教師在省級以上學術團體任職。學校實踐教學體系完善，有直屬附屬醫院2所。校內建有基礎實驗中心、護理實訓中心、臨床實訓中心、針灸推拿實訓中心和藥學實訓中心，校外與全國120余家二甲以上醫院、大中型企業通過校企合作，訂單培養等方式建立了創業就業基地。近年來，學校承擔國家級、市、區級科研項目26項，獲得省部級科技獎勵4項。在省級以上刊物公開發表論文521篇，編著出版學術專著和全國性教材57部（本）。學校建立“三峽中藥研究所”，致力于三峽庫區中藥產業發展，瀕危藥材搶救，優質藥材資源調查與保護開發，為中藥產業發展做出了突出成績，獲得重慶市科技進步獎。學校自1951年建校以來，秉承立足三峽，輻射周邊，面向農村，服務基層的辦學定位，以醫學教育和衛生職業教育為主體，為三峽庫區衛生人才培養，保障人民群眾健康作出了較大貢獻。特別是高專成立以來，始終把建設全國一流，西部領先的醫藥類高等專科學校作為奮斗目標，努力發揚傳統醫學與現代醫學相結合的特色，緊貼農村基層和社會需求，打造優勢專業品牌，中藥、針灸推拿、骨傷、護理等專業在全市乃至全國有較大影響。目前開設有臨床醫學、中醫學、中醫骨傷、針灸推拿、護理、藥學、醫學檢驗技術、口腔醫學技術等12個高職高專專業。五十多年來為三峽庫區及周邊區域培養了各級各類醫藥衛生人才7萬余名，庫區基層衛生單位80%的業務骨干為我校畢業生。學校辦學特色和辦學成績得到了社會各界的認可，是教育部、衛生部確定的“全國護理領域技能型緊缺人才培訓基地”，衛生部、國家中醫藥管理局確定的“全國中醫骨干培訓基地”，“全國鄉鎮衛生院院長培訓基地”，是“重慶市農村基層衛生人才繼續教育培訓基地”、“重慶市衛生職業技能鑒定站”、“三峽移民勞動技能培訓基地”、“三峽中醫藥國際培訓中心”。學校先后被國家中醫藥管理局、重慶市政府授予“職業教育工作先進集體”、“全國中醫藥科技工作先進集體”、“畢業生就業工作先進集體”、“最佳文明單位”。