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學校創建于1956年，由上海第一醫學院（現復旦大學上海醫學院）分遷來渝組建，原名重慶醫學院，1985年更名為重慶醫科大學。學校是國務院學位委員會批準的首批具有博士和碩士學位授予權的單位，是教育部批準的首批來華留學示范基地。學校2015年成為重慶市人民政府、國家衛生健康委員會（原國家衛生計生委）和教育部共建高校，2016年成為“高等學校學科創新引智計劃”（“111計劃”）首批立項的地方高校之一。

學校大力實施人才強校戰略，面向海外延攬高層次人才，成建制引進多個具有國際水平的人才團隊，加強本土人才引導與培育，逐步構建起“近悅遠來”的良好人才生態，形成推動內涵式發展的強勁動力。

學校科技創新能力不斷提升。多項成果在《柳葉刀》《自然·醫學》《新英格蘭醫學雜志》等國際頂級期刊發表。學校獨立研制的高強度聚焦超聲腫瘤治療系統（海扶刀）屬世界首創，是我國第一臺具有完全自主知識產權的大型醫療設備。學校成功研制出我國首個獲批上市化學發光法新冠病毒抗體檢測產品，現已獲得歐盟CE等多項認證�？萍汲晒D化成效顯著，化學發光法新冠抗體檢測試劑盒、腫瘤免疫治療等科技成果高質量完成轉化。

學校積極開展國內外交流合作。與歐洲、亞洲、北美洲、大洋洲的23個國家和地區的52所教育或醫療衛生機構建立了合作關系，其中包括美國達特茅斯學院、加拿大不列顛哥倫比亞大學、英國倫敦大學學院等國際名校；與英國萊斯特大學中外合作辦學項目已正式啟動，是我國西部地區唯一獲批的臨床醫學中外合作辦學項目；同時，與復旦大學、西南大學等“雙一流”建設高校開展長學制醫學生的聯合培養。