首都醫(yī)科大學(xué)建校于1960年，是北京市重點(diǎn)高等院校，是北京市政府、國家衛(wèi)生計(jì)生委、教育部共建院校。已故著名泌尿外科專家、兩院院士、全國人大常委會副委員長吳階平教授為首任校長。現(xiàn)任黨委書記呼文亮研究員，校長尚永豐院士。
學(xué)校校本部設(shè)有10個(gè)學(xué)院、1個(gè)學(xué)部和1個(gè)研究院，包括基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、藥學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院、中醫(yī)藥學(xué)院、衛(wèi)生管理與教育學(xué)院、全科醫(yī)學(xué)與繼續(xù)教育學(xué)院、馬克思主義學(xué)部、國際學(xué)院、燕京醫(yī)學(xué)院，北京腦重大疾病研究院。學(xué)校現(xiàn)有20所臨床醫(yī)學(xué)院暨附屬醫(yī)院，包括首都醫(yī)科大學(xué)宣武醫(yī)院（第一臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京友誼醫(yī)院（第二臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京朝陽醫(yī)院（第三臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京同仁醫(yī)院（第四臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京天壇醫(yī)院（第五臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京安貞醫(yī)院（第六臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬復(fù)興醫(yī)院（第八臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京佑安醫(yī)院（第九臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京胸科醫(yī)院（第十臨床醫(yī)學(xué)院）、首都醫(yī)科大學(xué)三博腦科醫(yī)院（第十一臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京地壇醫(yī)院（第十二臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京兒童醫(yī)院（兒科醫(yī)學(xué)院）、附屬北京口腔醫(yī)院（口腔醫(yī)學(xué)院）、附屬北京安定醫(yī)院（精神衛(wèi)生學(xué)院）、附屬北京婦產(chǎn)醫(yī)院（婦產(chǎn)醫(yī)學(xué)院）、附屬北京中醫(yī)醫(yī)院（中醫(yī)藥臨床醫(yī)學(xué)院）、附屬北京世紀(jì)壇醫(yī)院（腫瘤醫(yī)學(xué)院）、附屬北京康復(fù)醫(yī)院（北京康復(fù)醫(yī)學(xué)院）、附屬北京潞河醫(yī)院（潞河臨床醫(yī)學(xué)院）、中國康復(fù)研究中心（康復(fù)醫(yī)學(xué)院），以及預(yù)防醫(yī)學(xué)教學(xué)基地（北京市疾病預(yù)防控制中心）。學(xué)校還設(shè)有38個(gè)臨床專科學(xué)院、專科學(xué)系、中心。

學(xué)校學(xué)科力量雄厚。現(xiàn)有8個(gè)國家重點(diǎn)學(xué)科，2個(gè)國家重點(diǎn)（培育）學(xué)科；60個(gè)國家臨床重點(diǎn)專科（含中醫(yī)）；14個(gè)國家中醫(yī)藥管理局重點(diǎn)（培育）學(xué)科；4個(gè)北京市一級重點(diǎn)學(xué)科，6個(gè)北京市二級重點(diǎn)學(xué)科，1個(gè)北京市重點(diǎn)交叉學(xué)科，2個(gè)北京市一級重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，6個(gè)北京市二級重點(diǎn)建設(shè)學(xué)科，1個(gè)北京地區(qū)高等學(xué)校學(xué)科群。6個(gè)國家臨床醫(yī)學(xué)研究中心,1個(gè)國家兒童醫(yī)學(xué)中心,1個(gè)省部共建國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室培育基地，4個(gè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室，1個(gè)國家工程實(shí)驗(yàn)室,53個(gè)北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室。有8個(gè)一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)和11個(gè)一級學(xué)科碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)；按照三級學(xué)科統(tǒng)計(jì)，有59個(gè)博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)和78個(gè)碩士學(xué)位授權(quán)點(diǎn);具有所有醫(yī)學(xué)及醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科的碩士、博士專業(yè)學(xué)位授予權(quán)。有9個(gè)博士后科研流動站。
學(xué)校本專科專業(yè)齊全，設(shè)置的長學(xué)制專業(yè)中有臨床醫(yī)學(xué)、兒科學(xué)和口腔醫(yī)學(xué)；本科專業(yè)中有臨床醫(yī)學(xué)、基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、口腔醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)、藥學(xué)、中醫(yī)學(xué)、中藥學(xué)、護(hù)理學(xué)、生物醫(yī)學(xué)工程、假肢矯形工程、康復(fù)治療學(xué)、公共事業(yè)管理（衛(wèi)生管理）、醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)學(xué)、法學(xué)（衛(wèi)生法學(xué)）、臨床藥學(xué)、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)、兒科學(xué)、精神醫(yī)學(xué)、聽力與言語康復(fù)學(xué)19個(gè)專業(yè)。高職高專教育設(shè)有護(hù)理、醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)技術(shù)、藥學(xué)等14個(gè)專業(yè)。現(xiàn)有全日制在校生11517人，其中研究生3574人，長學(xué)制學(xué)生1714人，本科生3781人，高專高職生1863人，留學(xué)生585人；成教學(xué)生4300人。學(xué)校培養(yǎng)醫(yī)學(xué)與醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科的學(xué)術(shù)型和應(yīng)用型人才，形成了全方位、多層次、創(chuàng)新型人才培養(yǎng)模式。
學(xué)校目前有教育部、國家衛(wèi)生計(jì)生委“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃”試點(diǎn)項(xiàng)目4個(gè)；7個(gè)國家級特色專業(yè)和10個(gè)市級特色專業(yè)；7門國家級精品課程和18門市級精品課程，5門國家級精品資源共享課程，1門國家級精品視頻公開課；3個(gè)國家級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心和6個(gè)市級實(shí)驗(yàn)教學(xué)示范中心，3個(gè)國家級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新實(shí)驗(yàn)區(qū)和1個(gè)市級人才培養(yǎng)模式創(chuàng)新試驗(yàn)區(qū)，1個(gè)國家級大學(xué)生校外實(shí)踐教育基地，5個(gè)北京市級校外人才培養(yǎng)基地和1個(gè)素質(zhì)教育基地；7個(gè)國家級優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊(duì)和11個(gè)市級優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊(duì)，1名國家級教學(xué)名師和21名市級教學(xué)名師。通過教育教學(xué)改革實(shí)踐，學(xué)校共獲得教育教學(xué)成果獎(jiǎng)國家級特等獎(jiǎng)1項(xiàng)、二等獎(jiǎng)7項(xiàng)、優(yōu)秀獎(jiǎng)1項(xiàng)，市級特等獎(jiǎng)2項(xiàng)、一等獎(jiǎng)15項(xiàng)、二等獎(jiǎng)23項(xiàng)。2015年,學(xué)校高水平通過了教育部臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)認(rèn)證。
學(xué)校具有較強(qiáng)的學(xué)術(shù)發(fā)展與科研實(shí)力。在校本部和附屬醫(yī)院擁有一批國家級和市級重點(diǎn)學(xué)科和重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的基礎(chǔ)上，建有高水平的國家級、市級研究和培訓(xùn)機(jī)構(gòu)，如國家生命科學(xué)與技術(shù)人才培養(yǎng)基地、衛(wèi)生部全科醫(yī)學(xué)培訓(xùn)中心、北京市全科醫(yī)學(xué)培訓(xùn)中心、首都衛(wèi)生管理與政策研究基地等。有1個(gè)國家工程技術(shù)研究中心、4個(gè)教育部工程研究中心、10個(gè)北京市工程技術(shù)研究中心。有4個(gè)教育部創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)，2個(gè)科技部重點(diǎn)領(lǐng)域優(yōu)秀創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)。學(xué)校“人腦保護(hù)高精尖創(chuàng)新中心”獲批首批北京高校創(chuàng)新中心。近5年來，學(xué)校承擔(dān)了國家“973”、“863”、國家自然科學(xué)基金、國家社會科學(xué)基金、北京市自然基金，以及教育部、國家衛(wèi)生計(jì)生委、科技部、北京市科委、北京市教委等科研項(xiàng)目2865項(xiàng)（其中國家級科研項(xiàng)目1373項(xiàng)），累計(jì)科研經(jīng)費(fèi)21.4億元；獲得各類各級獎(jiǎng)勵(lì)68項(xiàng)，其中國家科技進(jìn)步獎(jiǎng)4項(xiàng)、北京市科技獎(jiǎng)28項(xiàng)、教育部高等學(xué)校科學(xué)研究優(yōu)秀成果獎(jiǎng)6項(xiàng)、教育部人文社科獎(jiǎng)2項(xiàng)、北京市哲學(xué)社會科學(xué)優(yōu)秀成果獎(jiǎng)2項(xiàng)、中華醫(yī)學(xué)科技獎(jiǎng)22項(xiàng)、吳階平醫(yī)學(xué)獎(jiǎng)2項(xiàng)、茅以升北京青年科技獎(jiǎng)2項(xiàng)；獲得專利授權(quán)520項(xiàng)。神經(jīng)生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、基礎(chǔ)免疫學(xué)、醫(yī)學(xué)圖像處理、生物信息檢測與處理、神經(jīng)內(nèi)科、神經(jīng)外科、心臟內(nèi)外科、腎移植、呼吸內(nèi)科、消化內(nèi)科、口腔生物醫(yī)學(xué)、眼科、耳鼻咽喉科、小兒血液病等在國內(nèi)外享有較高的聲譽(yù)。
學(xué)校和附屬醫(yī)院現(xiàn)有教職員工和醫(yī)務(wù)人員42467人（校本部1538人，附屬醫(yī)院40929人）。有院士7人，特聘顧問11人，正高職稱2315人，副高職稱3715人。其中教授769人（校本部105人，附屬醫(yī)院664人）,副教授1172人（校本部246人，附屬醫(yī)院926人）；博士生導(dǎo)師567人（校本部133人，附屬醫(yī)院434人），碩士生導(dǎo)師987人（校本部180人，附屬醫(yī)院807人）。校本部和附屬醫(yī)院總占地面積156.4萬平方米（校本部23.9萬平方米,附屬醫(yī)院132.5萬平方米）；總建筑面積245.1萬平方米（校本部32.4萬平方米，附屬醫(yī)院212.7萬平方米）；固定資產(chǎn)總值253.8億元（校本部31.1億元，附屬醫(yī)院222.7億元）；教學(xué)科研儀器設(shè)備總值23.6億元（校本部16.2億元，附屬醫(yī)院7.4億元）；圖書館藏書153.5萬冊（校本部88.8萬冊，附屬醫(yī)院64.7萬冊）；住院病床19764張。
學(xué)校有良好的教學(xué)科研輔助設(shè)施，建有圖書館、檔案館、校史館、中心實(shí)驗(yàn)室、信息與通訊中心、現(xiàn)代教育技術(shù)中心、臨床檢測中心、實(shí)驗(yàn)動物部、學(xué)報(bào)編輯部、中醫(yī)研修學(xué)院及首都國醫(yī)名師館、生命與健康博物館（籌）、校醫(yī)院等平臺。
學(xué)校十分重視國際、國內(nèi)交流與合作，先后與美國、加拿大、澳大利亞、英國、瑞典、挪威、香港、臺灣等19個(gè)國家和地區(qū)的50多所高校和相關(guān)單位簽訂了友好交流合作協(xié)議。先后接待50多個(gè)國家和地區(qū)的專家學(xué)者和學(xué)生數(shù)百人來校進(jìn)行學(xué)術(shù)交流和參觀訪問。目前，我校聘請的外籍專家共30人，聘請的外國及港澳臺地區(qū)客座教授73人；在校學(xué)歷教育海外學(xué)生585名，覆蓋40多個(gè)國家和地區(qū)。學(xué)校海外學(xué)生涵蓋了本科、碩士、博士研究生及進(jìn)修生。同時(shí)，學(xué)校通過多種渠道，選派師生出國出境學(xué)習(xí)、進(jìn)修，參加學(xué)術(shù)會議和考察訪問。
建校50多年來，學(xué)校形成了“扶傷濟(jì)世、敬德修業(yè)”的校訓(xùn)、“愛國奉獻(xiàn)、艱苦奮斗、救死扶傷、嚴(yán)謹(jǐn)求實(shí)”的校風(fēng)和“勤學(xué)、博思、求精、創(chuàng)新”的學(xué)風(fēng)，并形成了比較完整的學(xué)校文化標(biāo)識系統(tǒng)。同時(shí)，不斷以首醫(yī)人的奮斗歷程豐富著“首醫(yī)精神”的文化寶庫，激勵(lì)著首醫(yī)人繼續(xù)團(tuán)結(jié)奮進(jìn),全面提升學(xué)校核心競爭力，著力打造積極進(jìn)取的校園文化。
校黨委始終把加強(qiáng)黨的先進(jìn)性建設(shè)、推動事業(yè)科學(xué)發(fā)展作為學(xué)校黨建和思想政治工作的根本出發(fā)點(diǎn)和落腳點(diǎn)，“在沖鋒中建先鋒”的黨建理念深入人心。學(xué)校堅(jiān)持育人為本、德育為先，不斷加強(qiáng)學(xué)生德育和教育管理工作。2007年，學(xué)校獲評北京市黨建和思想政治工作先進(jìn)高校。全體首醫(yī)人求真務(wù)實(shí)、齊心協(xié)力、自主創(chuàng)新、和諧發(fā)展，正在努力將首都醫(yī)科大學(xué)建設(shè)成為高水平研究型醫(yī)科大學(xué)。