皖南醫學院排名2017排行第487名，相較于2017年的排行第466名，排名下降了21位。
皖南醫學院歷年排名情況
| 年度 | 全國排名 | 省內排名 | 總分 |
| 2017 | 487 | 18 | 60.33 |
| 2016 | 466 | 19 | 60.54 |
| 2015 | 499 | 19 | 60.49 |
| 2014 | 392 | 15 | 61.43 |
| 2013 | 416 | 14 | 60.09 |
皖南醫學院在安徽省排名情況
| 安徽省大學排名 | 學校名稱 | 學校類型 |
| 1 | 中國科學技術大學 | 理工 |
| 2 | 合肥工業大學 | 理工 |
| 3 | 安徽大學 | 綜合 |
| 4 | 安徽師范大學 | 師范 |
| 5 | 安徽農業大學 | 農林 |
| 6 | 安徽理工大學 | 理工 |
| 7 | 安徽工業大學 | 理工 |
| 8 | 安徽財經大學 | 財經 |
| 9 | 安徽醫科大學 | 醫藥 |
| 10 | 安徽建筑大學 | 理工 |
| 11 | 安徽工程大學 | 理工 |
| 12 | 淮北師范大學 | 師范 |
| 13 | 安徽中醫藥大學 | 醫藥 |
| 14 | 合肥學院 | 理工 |
| 15 | 安慶師范大學 | 師范 |
| 16 | 安徽科技學院 | 理工 |
| 17 | 皖西學院 | 綜合 |
| 18 | 皖南醫學院 | 醫藥 |
| 18 | 合肥師范學院 | 師范 |
| 20 | 黃山學院 | 綜合 |
| 20 | 蚌埠醫學院 | 醫藥 |
| 20 | 阜陽師范學院 | 師范 |
| 23 | 滁州學院 | 綜合 |
| 24 | 巢湖學院 | 綜合 |
| 25 | 淮南師范學院 | 師范 |
| 26 | 銅陵學院 | 財經 |
| 27 | 宿州學院 | 綜合 |
| 28 | 池州學院 | 綜合 |
| 29 | 蚌埠學院 | 理工 |
| 30 | 亳州學院 | 綜合 |
